توالی اجماع محتویات آنالیز توالی جستارهای وابسته منابع منوی ناوبری
بیوانفورماتیکدیانای
زیست شناسی مولکولیبیو انفورماتیکنوکلئوتیداسید آمینههمتراز کردن توالیهمترازسازی چند توالی لوگوی دنبالهآرانای پلیمرازpattern recognitionsequence motifsregulatory sequencesignal sequenceتکاملDNApyrimidinepurine
توالی اجماع
پرش به ناوبری
پرش به جستجو
در زیست شناسی مولکولی و بیو انفورماتیک، توالی اجماع(مورد توافق)، ترتیب فراوانترین واحد (residues)محاسبه شده در یک رشته -چه نوکلئوتید و چه اسید آمینه- است که در هر نقطه از تراز توالی(همتراز کردن توالی) یافت شدهاست. توالی اجماع نتایج همترازسازی چند توالی (MSA) را بیان میکند که توالیهای به هم مرتبط با هم مقایسه و موتیفهای توالی (لوگوی دنباله های) مشابه محاسبه میشوند. این اطلاعات هنگامی که با آنزیمهایی با توالی مستقل مانند آرانای پلیمراز.[۱] کار میکنیم مهم هستند.
محتویات
۱ آنالیز توالی
۱.۱ نام گذاری
۲ جستارهای وابسته
۳ منابع
آنالیز توالی
نرم افزارهای شناخت الگو (pattern recognition) یک موضوع عمده در ژنتیک، بایولوژی مولکولی و بایو انفورماتیک محسوب میشوند. موتیفهای توالی (sequence motifs )ویژه میتوانند مانند توالیهای تنظیمی (regulatory sequence) برای کنترل بایو آنزیمها یا مانند توالیهای علامت (signal sequence)که یک مولکول را به یک مکان مشخص در سلول هدایت میکنند یا بلوغ سلول را تنظیم میکنند، عمل کنند. از آنجایی که عمل تنظیم این توالیها مهم است، این طور در نظر گرفته میشود که در طول دورههای طولانی تکامل محافظت شدهاند و تغییر چندانی نکردهاند. در پارهای از موارد میتوان با استفاده از مقدار محافظت این مکانها ارتباط تکاملی را تخمین زد.
نام گذاری
موتیف توالی محافظت شده (conserved sequence motifs) توالی اجماع نامیده میشوند و نشان میدهند که چه ساکنهایی (residues)محافظت شده و چه ساکنهایی متغیر هستند. برای مثال نمونه DNA زیر را در نظر بگیرید:
A[CT]NAYR
در این نوع نام گذاری، A به این معنی است که در این مکان همیشه A است. [CT] یعنی در این مکان یا C داریم یا T. برای نشان دادن اینکه در این مکان هر بازی میتواند قرار بگیرد از علامت N استفاده میکنیم. A یعنی هر بازی بع غیر از A و Y نمایانگر هر pyrimidine و R نشان دهند هر purine است.
جستارهای وابسته
- ماتریس وزن موقعیت خاص
- دنبالهی موتیف
- لوگوی دنباله
منابع
↑ Pierce, Benjamin A. 2002. Genetics : A Conceptual Approach. 1st ed. New York: W.H. Freeman and Co.
ردهها:
- بیوانفورماتیک
- دیانای
(window.RLQ=window.RLQ||[]).push(function()mw.config.set("wgPageParseReport":"limitreport":"cputime":"0.024","walltime":"0.034","ppvisitednodes":"value":70,"limit":1000000,"ppgeneratednodes":"value":0,"limit":1500000,"postexpandincludesize":"value":133,"limit":2097152,"templateargumentsize":"value":0,"limit":2097152,"expansiondepth":"value":4,"limit":40,"expensivefunctioncount":"value":0,"limit":500,"unstrip-depth":"value":0,"limit":20,"unstrip-size":"value":345,"limit":5000000,"entityaccesscount":"value":0,"limit":400,"timingprofile":["100.00% 5.825 1 الگو:پانویس","100.00% 5.825 1 -total"],"cachereport":"origin":"mw1275","timestamp":"20190317073538","ttl":2592000,"transientcontent":false););"@context":"https://schema.org","@type":"Article","name":"u062au0648u0627u0644u06cc u0627u062cu0645u0627u0639","url":"https://fa.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%88%D8%A7%D9%84%DB%8C_%D8%A7%D8%AC%D9%85%D8%A7%D8%B9","sameAs":"http://www.wikidata.org/entity/Q1295754","mainEntity":"http://www.wikidata.org/entity/Q1295754","author":"@type":"Organization","name":"u0645u0634u0627u0631u06a9u062au200cu06a9u0646u0646u062fu06afu0627u0646 u067eu0631u0648u0698u0647u0654 u0648u06ccu06a9u06ccu200cu0645u062fu06ccu0627","publisher":"@type":"Organization","name":"Wikimedia Foundation, Inc.","logo":"@type":"ImageObject","url":"https://www.wikimedia.org/static/images/wmf-hor-googpub.png","datePublished":"2012-07-09T22:46:27Z","dateModified":"2018-10-21T15:15:52Z"(window.RLQ=window.RLQ||[]).push(function()mw.config.set("wgBackendResponseTime":109,"wgHostname":"mw1274"););
